Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME1P15531 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME1P15531 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME1P15531 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME1P15531 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME1P15531 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME1P15531 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME1P15531 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms