Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTHFD1P11586 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms