Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIMD1P0DJR0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms