Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN2P05204 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms