Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms