Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN1O60240 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms