Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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