Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYNGR2O43760 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms