Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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