Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLGNO14967 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLGNO14967 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLGNO14967 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms