Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPA3F8WFD2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms