Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VGLL3A8MV65 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms