Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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