Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms