Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FRMD3A2A2Y4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms