Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms