Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBNO2Q9Y2G9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms