Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms