Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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