Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms