Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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