Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms