Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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