Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms