Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms