Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms