Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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