Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3Q9BXJ4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms