Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms