Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms