Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms