Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q96MF0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q96MF0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q96MF0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms