Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRAT1Q92837 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms