Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYRIPQ8NFW9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms