Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRELID2Q8N945 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms