Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBRM1Q86U86 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBRM1Q86U86 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms