Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TCF23Q7RTU1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms