Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER1Q5JTC6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms