Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN4Q5BKX8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAVIN4Q5BKX8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms