Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms