Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms