Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms