Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms