Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms