Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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