Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms