Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms