Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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