Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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