Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPEGQ15772 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms